Hakikatnya, PGMI IAIN Palopo lahir untuk memenuhi kebutuhan tersedianya guru SD/MI di wilayah Luwu Raya, Sulawesi Selatan. Oleh karena itu, tim penyusun proposal pembukaan program studi baru STAIN IAIN Palopo melakukan audience dengan pemerintah-pemerintah daerah di daerah Luwu Raya (Kabupaten Luwu, Luwu Utara, Luwu Timur, dan Kota Palopo) untuk memperoleh dukungan. Akhirnya, setelah proses tersebut maka diajukanlah proposal pembukaan penyelenggaraan prodi PGMI ke Dirjen Pendis.
Program Studi Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah (PGMI) IAIN Palopo lahir dan berdiri pada tanggal 13 Agustus 2012 ditandai dengan terbitnya Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Islam nomor 1189 tahun 2012 tentang izin penyelenggaraan program studi strata satu pada Sekolah Tinggi Agama Islam Negeri Palopo tahun 2012.
Saat ini, Program Studi PGMI IAIN Palopo telah terakreditasi Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi berdasarkan Keputusan BAN-PT No. 1739/SK/BAN-PT/Akred/S/III/2021, menyatakan bahwa Program Studi Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah, Pada Program Sarjana IAIN Palopo, Kota Palopo memenuhi syarat peringkat Akreditasi A.
Pimpinan Program Studi PGMI IAIN Palopo dari masa ke masa:
- Periode 2012 – 2016
Ketua Prodi : Dr. Firman, S.Pd.,M.Pd.
Sekretaris : Dr. Hj. Salmilah, S.Kom.,M.T.
- Periode 2016 – 2019
Ketua Prodi : Dr. Edhy Rustan, M.Pd.
Sekretaris : Rosdiana, S.Kom.,M.T.
- Periode 2019 – 2021
Ketua Prodi : Dr. Edhy Rustan, M.Pd.
Sekretaris : Mirnawati, S.Pd.,M.Pd.
- Periode 2021 – 2023
Ketua Prodi : Mirnawati, S.Pd.,M.Pd.
Sekretaris : Dr. A. Muhammad Ajigoena, M.Pd.
- Periode 2023 – 2027
Ketua Prodi : Dr. Muhammad Guntur, S.Pd.,M.Pd.
Sekretaris : Nurul Aswar, S.Pd.,M.Pd.